V tomto předmětu se seznámíte se základními prvky “Computational chemistry” z praktického hlediska – s minimem teorie, kterou odsouváme do předmětu Teoretická chemie. V plánu jsou základy klasického molekulárního modelování a simulací (SIMOLANT, MACSIMUS), kvantových výpočtů (GAUSSIAN), a počítačové biochemie (PYMOL). Naplánována je i přednáška na téma databází vlastností látek.
Zkouška bude udělena za:
- Úspěšné složení písemného testu (alespoň 50 %). Test obsahuje otázky, zpravidla s výběrem a), b), c) ..., z probrané teorie a příklad na orientaci ve výstupu z programu Gaussian vč. jednoduchých výpočtů.
- Vypracování a obhajobu projektu vč. protokolu.
Studijní literatura
- Atkins P.W.: Physical Chemistry, Oxford University Press, 2006
- Skripta Fyzikální chemie – magisterský kurs (J. Novák a kolektiv, VŠCHT Praha 2008), viz literatura
- Computational Chemistry Using the PC
- Materiály pro molekulové simulace