V časopise Accounts of Chemical Research vyšel přehledový článek Thermodynamic Principles Behind Mechanisms and Reactivities: Hydrogen Atom Abstraction and Related Radical Reactions, jehož spoluautorem je Daniel Bím z Ústavu fyzikální chemie.

Text se zabývá reakcemi spojenými s přenosem atomu vodíku: tedy procesy, které stojí za fungováním řady enzymů, podílejí se na buněčném dýchání i fotosyntéze a využívají se při moderní syntéze organických molekul. Přestože jsou tyto reakce velmi rozšířené, jejich rychlost a selektivitu je často obtížné předpovědět.

Autoři ukazují, že rozhodující není jen celková energetická bilance reakce, ale také to, jak je při reakci vzájemně svázán přenos elektronu a protonu (tedy částic, ze kterých se atom vodíku skládá). Tento vztah je představen pomocí konceptu tzv. mimodiagonální termodynamiky (angl. off-diagonal thermodynamics), který umožňuje rychlost reakce i její selektivitu předpovídat kvantitativně a vysvětlit tak případy, kdy například silnější vazba reaguje přednostně před slabší.

Daniel Bím se tématu věnuje od doktorského studia, kdy ve spolupráci s Martinem Srncem (Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského, AV ČR) formuloval základní principy tohoto konceptu. Martin Srnec následně teorii systematicky rozšířil, začlenil ji do širšího rámce teorie přenosu protonu a elektronu a aplikoval na různé další typy reakcí. Současná publikace tak představuje nejen shrnutí několikaletého vývoje této teorie, ale i pokračování dlouhodobé a úspěšné spolupráce obou autorů.

Zveme vás na sérii odborných přednášek od předních českých i zahraničních odborníků z oblastí na pomezí molekulárního modelování, kvantové a teoretické chemie, biofyziky a biochemie. Tato přednášková řada nabídne fascinující vhledy do nejnovějších vědeckých poznatků a jejich aplikací.

Program semináře na zimní semestr 2025/26 konajícího se v pátek od 14:30 v místnosti B2319 nebo v klubu ÚOChB.

Doc. Kolář v redakční radě posílí sekci Biofyziky a strukturní biologie. Odborně se totiž věnuje biomolekulám a jejich konformační dynamice. Jeho tým se zaměřuje na okolnosti, za kterých v buňkách vznikají bílkoviny. Communications Biology je Open Access časopis, který publikuje výsledky základního výzkumu všech podoborů biologie s důrazem na důkladné a rychlé recenzní řízení včetně např. double-blind nebo open review. Redakční zpracování každého manuskriptu zajišťuje globální tým interních editorů a členů redakční rady.

Petr Slavíček a Jiří Janoš společně s Basile Curchod z Bristol University diskutují o limitech přístupů založených na trajektoriích pro fotochemické simulace: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.accounts.4c00687

Petr Slavíček získal studentskou cenu Vitriol pro nejoblíbenějšího pedagoga FCHI a cenu MŠMT za mimořádné výsledky výzkumu, experimentálního vývoje a inovací.

Blahopřejeme!

Foto: MŠMT

Podpořený projekt se zaměřuje na vývoj pokročilých niklových katalyzátorů pro efektivní využití v redoxních a fotochemických reakcích jako šetrné alternativy k metodám využívajícím drahé a toxické kovy.

Laboratoř výpočetní termodynamiky ve spolupráci s Technische Universität Berlin představuje v nové studii publikované v časopise Molecular Pharmaceutics schopnosti modelu COSMO-SAC, který využívá kvantově-mechanická data, předpovídat vzájemnou kompatibilitu léčiv a polymerů. Ta je klíčovým aspektem při navrhování lékových forem na bázi amorfních pevných disperzí. Související výpočetní nástroj COSMOPharm je volně dostupný na GitHub. Studie vznikla za podpory Grantové agentury ČR (projekt 22-07164S).

Nová studie „How Does Mg²⁺_(aq) Interact with ATP_(aq)? Biomolecular Structure through the Lens of Liquid-Jet Photoemission Spectroscopy“ byla publikována v časopise Journal of the American Chemical Society. Skupina PHOTOX z našeho ústavu v něm přinesla interpretaci experimentálních výsledků.

Od akademického roku 2019/20 otevíráme nový bakalářský program Fyzikální a výpočetní chemie, který nabízí progresivní a atraktivní spojení chemie a výpočetní techniky.

Přihlašovat ke studiu se můžete až do 31. března 2019.