Jiří je studentem 3. ročníku gymnázia a rád plave s ploutvemi. Kromě sportu pěstuje i zájem o chemii a přírodní vědy. S vedoucím laboratoře, doc. Kolářem, se seznámil během Letního odborného soustředění mladých chemiků a biologů v Běstvině a krátce na to začal studovat detaily bakteriální proteosyntézy.

Ve všech organismech probíhá syntéza proteinů v hrubých rysech stejně, jisté rozdíly přesto existují. Jedním z nich je přítomnost tzv. peptidové deformylázy (PDF) v bakteriích, která u vyšších organismů chybí. PDF má za úkol chemicky modifikovat začátek každého proteinu, který bakterie vyprodukuje, a představuje tak jeden z cílů antibiotické terapie. PDF se váže na ribozom, buněčnou továrnu na proteiny, skrze tzv. C-koncovou část. Ukazuje se, že různé bakterie mají PDF s různými C-koncovými částmi. Některé jsou schopné tvořit tzv. α-helix, a tím se vázat na ribozom, jiné α-helix nejspíš netvoří a není známo, jak se na ribozom vážou. Na C-koncové části se zaměřil i výzkum Jiřího Kubíčka.

Obrázek: C-koncová část peptidové deformylázy, která vykazuje vysokou helicitu (A) nebo zanedbatelnou helicitu (B), a autor studie Jiří Kubíček (C).

Provedl molekulárně dynamické počítačové simulace, aby objasnil náchylnost různých PDF tvořit α-helix, tzv. helicitu. Z pěti studovaných C-koncových části pouze jedna vykazovala vysokou helicitu. Ostatní části se z hlediska helicity chovaly srovnatelně a α-helix téměř netvořily. Poznatky získané během studie pomohou osvětlit způsob vazby nehelikálních C-koncových částí PDF na ribozom, a v dlouhodobém horizontu tak mohou přispět k novým strategiím léčby bakteriálních nemocí. 

SOČ je mnohooborová soutěž pořádaná od roku 1979 pro středoškolské studenty a studentky se zájmem o vědu. Během školního, okresního, krajského a celostátního kola soutěže musí účastníci před odbornými komisemi obhájit vědeckou práci, kterou obvykle vypracovávají ve spolupráci s univerzitami či vědeckými institucemi. Účastníci tak mají již na střední škole možnost vyzkoušet si skutečný výzkum včetně rešerše literatury, získání výsledků a jejich kritického zhodnocení. Ti nejlepší poté reprezentují Česko na zahraničních soutěžích podobného formátu.

Od akademického roku 2019/20 otevíráme nový bakalářský program Fyzikální a výpočetní chemie, který nabízí progresivní a atraktivní spojení chemie a výpočetní techniky.

Přihlašovat ke studiu se můžete až do 31. března 2019.