Arian Adam Ott ze skupiny Dr. Koláře uspěl v Celostátní přehlídce 43. ročníku soutěže SOČ

Druhý týden v červnu proběhla virtuální Celostátní přehlídka Středoškolské odborné činnosti (SOČ). Arian A. Ott, student Gymnázia Rokycany působící v Laboratoři dynamiky biomolekul na našem ústavu, se umístil na 5. místě v kategorii Biologie s prací nazvanou “Studium vlastností peptidů ve stavu zrodu pomocí počítačových simulací.” Srdečně blahopřejeme!

Arian se začal seznamovat s počítačovými simulacemi biomolekul během letních prázdnin mezi 2. a 3. ročníkem na gymnáziu. S vedoucím laboratoře, Dr. Michalem H. Koláře se seznámil během Letního odborného soustředění mladých chemiků a biologů na Běstvině a téma syntézy bílkovin ho zaujalo natolik, že mu věnoval nemálo svého volného času.

Arian se zabýval studiem ribozomu, což je buněčná továrna zodpovědná za tvorbu všech bílkovin v živých organizmech. Funguje jako katalyzátor reakce, při níž se spojuje karboxylová skupina -COOH a aminoskupinou -NH2 mezi aminokyselinami, stavebními bloky bílkovin. Chemická reakce probíhá hluboko uvnitř ribozomu. Nově vznikající řetízek bílkoviny tedy opouští ribozom asi 10 nm dlouhým tunelem. Informace o tom, co se děje s bílkovinou ve stavu zrodu uvnitř ribozomálního tunelu jsou zatím jen kusé. Arian s Michalem se pomocí atomistických simulací podívali na konformační chování vybraných pentapetidů uvnitř tunelu. Sledovali rozdíly ve struktuře a dynamice tunelu způsobené rozdílnými sekvencemi pentapeptidů. Přestože se jedná o velice zjednodušené simulace, jejich výsledky naznačují cestu, kterou je výhodné se vydat při hledání odpovědi na otázku, jak se rodí proteiny.

SOČ je mnohooborová soutěž pořádána od roku 1979 pro středoškolské studenty a studentky se zájmem o vědu. Během školního, okresního, krajského a celostátního kola soutěže musí účastníci před odbornými komisemi obhájit vědeckou práci, kterou obvykle vypracovávají ve spolupráci s univerzitami či vědeckými institucemi. Účastníci tak mají již na střední škole možnost vyzkoušet si skutečný výzkum včetně rešerše literatury, získání výsledků a jejich kritického zhodnocení. Ti nejlepší poté reprezentují Česko na zahraničních soutěžích podobného formátu.

Od akademického roku 2019/20 otevíráme nový bakalářský program Fyzikální a výpočetní chemie, který nabízí progresivní a atraktivní spojení chemie a výpočetní techniky.

Přihlašovat ke studiu se můžete až do 31. března 2019.